Родился 26 марта 1919 года в селе Подосиновец Великоустюжского уезда Северо-Двинской губернии (ныне Подосиновского района Кировской области) в семье протоиерея Зосимы Васильевича Трубачёва (1893—1938, расстрелян в Бутове, священномученик) и его супруги Клавдии Георгиевны Трубачёвой (урождённой Санковой) (1898—1982). Сергей с юных лет пел в церковном хоре и прислуживал за богослужениями в алтаре В 1932 году семья репрессированного протоиерея Зосимы поселилась у родственников в Сергиевом Посаде и с тех пор вся жизнь Сергея Трубачёва была неразрывно связана с этой твердыней русского православия. Здесь, в годы учёбы, началась его дирижёрская деятельность. Он руководил хором, созданным при оптико-механическом заводе, выступления которого были вполне на профессиональном уровне. 20 августа 1995 года в академическом храме в честь Покрова Пресвятой Богородицы ректор Московской духовной академии епископ Верейский Евгений (Решетников) совершил его хиротонию во диакона. Указом Святейшего Патриарха Алексия II диакон Сергий Трубачёв был определён «к служению в Троице-Сергиевой Лавре и её скитах сверхштатным диаконом». Однако служение отца Сергия было недолгим. 15 октября 1995 года, в воскресенье, отец Сергий служил в последний раз в семинарском храме преподобного Иоанна Лествичника, в ночь с 19 на 20 октября его срочно госпитализировали в Сергиевопосадскую центральную больницу. Скончался отец Сергий 25 октября 1995 года.
